纳税方式：
1、就合同总标的减去分包价后的余额按建筑业税目纳营业税，政策依据是营业税暂行条例及国税函发[1995]156号，实践中施工地的地方税务主管部门也会要求如此操作。
2、 分别纳税：政策依据为国税发[2002]117号，即对销售货物和提供增值税应税劳务取得的收入征收增值税，提供建筑业劳务收入(不包括按规定应征收增值税的自产货物和增值税应税劳务收入)按建筑业税目征收营业税，对设计按其他服务业税目征收营业税。但工程总承包企业不是生产企业，应该不适用该法规；
3、 按混合销售全部缴纳增值税：这种做法一般设备所占的比重较大，其政策依据为增值税暂行条例中关于混合销售的规定。2009年以后，业主出于设备抵扣进项税额的需求，也会要求提供增值税专用发票。
注：上述对同一事项的处理有不同的纳税方式，主要受到业主及施工地主管税务机关的影响，使税法的严谨性无法体现，请明示上述业务正确的纳税方式。
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