为确保专项实施能够取得应有的效果，在专项的组织实施过程中，把握好以下几项原则：
1、统筹规划，合理布局。根据各国家生物产业基地发展规划，科学合理布局，避免重复建设，并与基地发展方向和发展重点保持一致；
2、中央和地方分别支持。除专项拟支持的基地实验动物中心、医药中试生产中心和公共实验中心外，基地临床试验中心、新药注册服务中心、投融资服务中心、信息中心等由地方研究予以支持；
3、突出公共服务。为基地内各类企业和研究机构提供技术开发、产业化和政策方面的公共服务支撑；
4、坚持市场化运作。基地公共服务条件建设项目以公共服务为目的，但应坚持市场化运作。
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